889 schenkte König Arnolf seinem Erzkanzler Aspert die Kapelle im Königshof Ufhusa auf Lebenszeit, mit der Befugnis, sie an das Domkapitel oder an das Kloster St. Emmeram zu übertragen. 1267 wurde letzterem die Pfarrei A, für die es schon das Patronatsrecht hatte, inkorporiert. Erster namentlich bekannter Pfarrer war der 1317 verstorbene Hainricus Schambeck. St. Emmeram übte das Präsentationsrecht bis zur Säkularisation aus, wonach es auf den Staat überging. Seit 1918/28 hat der Bischof das freie Verleihungsrecht. - Ein Benefizium in Truftlfing gab es schon 1438. Seit der Mitte des 18. Jhs war es mit der Schlosskaplanei in Alteglofsheim verbunden, wohl weil der dortige Schlossherr das Präsentationsrecht hatte. In den letzten Jahrzehnten war die Stelle nicht mehr besetzt. - Auch in Uttenchofen (Irnkofen) bestand mindestens seit 1438 ein Benefizium, das aber etwa seit der Mitte des 15. Jhs regelmäßig dem jeweiligen Pfarrer von A übertragen wurde. - Walkofn ist 1526 als Filiale von A mit Sepultur nachgewiesen. Nachdem schon seit 1921 in Wallkofen meist ein eigener Seelsorger tatig war, wurde es 1954 förmlich zur Expositur erhoben, die aber in den letzten Jahren nicht mehr besetzt werden konnte. - J. G. Seidenbusch, der 1667 zum Pfarrer von A bestellt wurde, brachte aus München ein Marienbild mit, durch das in A seit 1668 eine bedeutende Wallfahrt entstand. Er gründete dort 1675ff. auch das erste Nerianeroratorium im deutschsprachigen Raum. In der Folgezeit war der jeweilige Propst dieses Instituts zugleich Pfarrer von A u. wurde von den übrigen Priestern des Oratoriums in der Seelsorge unterstützt. 1886 erlosch das Institut personell, wurde aber von Benediktinern aus Metten, die 1890 das Stiftungsgut u. die Pfarrei übernahmen, weitergeführt, bis sie sich 1978 wieder aus A zurückzogen. Seit 2006 besteht wieder ein Oratorium des Hl. Philipp Neri. - Die Armen Schulschwestern, die seit 1901 in A einen Kindergarten u. eine private Handarbeitsschule betrieben u. seit 1904 in der Mädchenschule wirkten, wurden 1958 abgezogen.
Ortschaften in der Pfarrei (Stand 1997): Aufhausen, Gansbach, Haid, Irnkofen, Mittermühle, Neumühle, Niederhinkofen, Petzkofen, Schlappmühle, Triftlfing, Ziegelstadel.